26 mar. 2016

Usar Anaconda desde un contenedor Docker

Continuando con artículos relacionados con Docker. Está vez se mostrará como correr Anaconda desde una imagen Docker.


A continuación les dejo los artículos anteriores:

  1. Instalar Docker en Debian Jessie
  2. Uso de Docker en Debian Jessie (parte 1)
  3. Uso de Docker en Debian Jessie (parte 2)
  4. Crear una imagen Docker a partir de un archivo Dockerfile
  5. Iniciando Django usando Docker
  6. Instalar Gitlab por medio de Docker
  7. Ejecutando microservicios con docker usando docker-compose
  8. Docker en Docker (DinD)
  9. Iniciando Django con docker usando docker-compose con postgresql como microservicio.
  10. Importar un contenedor Docker en Python.
  11. Compartir imagenes Docker por medio de archivos tar.
  12. Crear un registro de imagenes Docker privado.

Lo primero que se estarán preguntando es, ¿Qué es Anaconda?. 

La respuesta se la pueden conseguir en el enlace oficial del sitio continuum:

Anaconda es un manejador de paquetes (libre y fácil de instalar),manejo de entorno, distribución de Python, y una colección de más de 720 paquetes opensource con soporte comunitario. Además se puede instalar más de mil paquetes con el comando conda install <paquete>, funciona en Linux, Windows y OSX.  Anaconda es la herramienta hecha para cientificos de datos.

¿Quienes más usan anaconda?
  • Cientificos de Datos
  • Desarrolladores
  • Ingenieros de Datos
  • DevOps
  • Analistas de negocios
El procedimiento para usar anaconda lo explican en este enlace.

Las imagenes existentes de anaconda la pueden ver en este enlace.

Para ver las imagenes de la gente de continuum se realiza una busqueda con docker:

$docker search continuumio

NAME                                   DESCRIPTION                                           STARS     OFFICIAL   AUTOMATED
continuumio/anaconda                 Powerful and flexible python distribution    27                   [OK]
continuumio/miniconda                Powerful and flexible package manager     14                   [OK]
continuumio/anaconda3                                                                               10                   [OK]
continuumio/miniconda3                                                                                5                    [OK]
continuumio/memex_explorer      memex explorer app                                   1                    
continuumio/solr                          solr 10.4.2 + tika                                       0                    
continuumio/tika                          Tika 1.9                                                     0                    
continuumio/binstar-build-linux64                                                                  0                    [OK]
continuumio/kibana                                                                                       0                    
continuumio/imagecat                   Docker Container for ImageCat                0                    
continuumio/banana                                                                                      0

Luego se bajará la imagen miniconda:

$ docker pull continuumio/miniconda

Using default tag: latest
latest: Pulling from continuumio/miniconda
a3ed95caeb02: Pull complete 
79362e2488a1: Pull complete 
41938770486e: Pull complete 
1c66b99d17cb: Pull complete 
33e1cf31bc39: Pull complete 
Digest: sha256:5d27e59a93068184fc6dd63043746ad35aa15dd2862ff0babd391bc3c05a5fc4
Status: Downloaded newer image for continuumio/miniconda:latest

Ahora se puede iniciar un contenedor a partir de la imagen que se descargó:
$ docker run -t -i continuumio/miniconda /bin/bash
root@f7115572fad4:/# 

Se prueba que conda está instalado en ese contenedor:

ernesto@jewel:~/dockerfiles$ docker run -t -i continuumio/miniconda /bin/bash
root@f7115572fad4:/# conda info
Current conda install:

             platform : linux-64
        conda version : 3.19.0
  conda-build version : not installed
       python version : 2.7.11.final.0
     requests version : 2.9.0
     root environment : /opt/conda  (writable)
  default environment : /opt/conda
     envs directories : /opt/conda/envs
        package cache : /opt/conda/pkgs
         channel URLs : https://repo.continuum.io/pkgs/free/linux-64/
                        https://repo.continuum.io/pkgs/free/noarch/
                        https://repo.continuum.io/pkgs/pro/linux-64/
                        https://repo.continuum.io/pkgs/pro/noarch/
          config file : None
    is foreign system : False



Ahora se instalará scipy vía el comando conda:
root@f7115572fad4:/# conda install scipy
Fetching package metadata: ....
Solving package specifications: ....................
Package plan for installation in environment /opt/conda:

The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    libgfortran-3.0            |                0         261 KB
    mkl-11.3.1                 |                0       121.2 MB
    openssl-1.0.2g             |                0         3.2 MB
    sqlite-3.9.2               |                0         3.9 MB
    numpy-1.10.4               |           py27_1         6.0 MB
    requests-2.9.1             |           py27_0         605 KB
    setuptools-20.3            |           py27_0         452 KB
    wheel-0.29.0               |           py27_0          81 KB
    conda-4.0.5                |           py27_0         185 KB
    pip-8.1.1                  |           py27_0         1.5 MB
    scipy-0.17.0               |      np110py27_2        30.1 MB
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:       167.3 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

    libgfortran: 3.0-0             
    mkl:         11.3.1-0          
    numpy:       1.10.4-py27_1     
    scipy:       0.17.0-np110py27_2

The following packages will be UPDATED:

    conda:       3.19.0-py27_0 --> 4.0.5-py27_0      
    openssl:     1.0.2d-0      --> 1.0.2g-0          
    pip:         7.1.2-py27_0  --> 8.1.1-py27_0      
    requests:    2.9.0-py27_0  --> 2.9.1-py27_0      
    setuptools:  18.8.1-py27_0 --> 20.3-py27_0       
    sqlite:      3.8.4.1-1     --> 3.9.2-0           
    wheel:       0.26.0-py27_1 --> 0.29.0-py27_0     

Proceed ([y]/n)? y

Otra opción es bajar continuumio/anaconda, que tiene la paqueteria base:

$ docker pull continuumio/anaconda

Y se ejecuta el contenedor:
ernesto@jewel:~/dockerfiles$ docker run -t -i continuumio/anaconda /bin/bash
root@f7115572fad4:/#


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